معرفی آگاروز

آگاروز (Agarose) یک پلی‌ساکارید طبیعی و خالص‌شده است که از آگار (Agar) استخراج می‌شود. این ماده بخش ژل‌ساز آگار است و از زنجیره‌های بلند گالاکتوز تشکیل شده است.
آگاروز به دلیل خلوص بالا و خاصیت ژل‌کنندگی دقیق، در زیست‌شناسی مولکولی، بیوشیمی و میکروبیولوژی کاربرد گسترده‌ای دارد.

ویژگی‌ها و خواص فیزیکی و شیمیایی

فرمول شیمیایی: (C₁₂H₁₈O₉)ₙ

جرم مولی: حدود 120000 گرم بر مول (بسته به طول زنجیره)

شکل ظاهری: پودر سفید یا شیری رنگ

حلالیت: در آب داغ محلول، در آب سرد نامحلول

دمای ذوب ژل: حدود 85–95 °C

دمای ژل شدن: حدود 35–40 °C

pH محلول: خنثی (۶ تا ۸)

ژل آگاروز به دلیل منافذ یکنواخت خود، بستری مناسب برای جداسازی مولکول‌های بزرگ زیستی مانند DNA، RNA و پروتئین‌ها است.

کاربردهای آگاروز

۱. در زیست‌شناسی مولکولی:

تهیه ژل برای الکتروفورز DNA و RNA (Agarose Gel Electrophoresis)

ارزیابی خلوص و اندازه مولکول‌های نوکلئیک اسید

جداسازی محصولات PCR و بررسی پلاسمیدها

۲. در بیوشیمی و پروتئین‌شناسی:

استفاده در کروماتوگرافی تعادلی برای جداسازی پروتئین‌ها

ساخت بسترهای خنثی در روش‌های ایمونوشیمی (مثل Immunodiffusion)

۳. در میکروبیولوژی:

به‌عنوان ژل خالص برای کشت‌های خاص که نیاز به محیط بدون ناخالصی دارند

نحوه تهیه و استفاده

برای تهیه ژل آگاروز در الکتروفورز:

مقدار مشخصی از پودر آگاروز (مثلاً ۱ گرم در ۱۰۰ میلی‌لیتر بافر TAE یا TBE) را در ظرف مقاوم به حرارت بریزید.

با حرارت (مایکروویو یا بن‌ماری) تا انحلال کامل گرم کنید.

پس از کمی خنک شدن، به قالب بریزید تا در دمای اتاق ژل شود.
غلظت ژل معمولاً بین ۰٫۸ تا ۲ درصد است و بسته به اندازه مولکول مورد نظر تنظیم می‌شود.

نکات ایمنی و نگهداری

آگاروز غیرسمی و بی‌خطر است.

در محل خشک و خنک نگهداری شود.

از تماس با رطوبت جلوگیری شود تا خاصیت ژل‌کنندگی کاهش نیابد.

هنگام ذوب کردن با مایکروویو از داغ شدن بیش از حد جلوگیری کنید.